第十三届国际基因组学大会（简称ICG-13）10月底在深圳落下帷幕★ღ。这次会议邀请了美国国家人类基因组研究所（NHGRI）的学者★ღ，介绍了该所在基因组学学科未来规划的一些情况★ღ。目前★ღ，NHGRI已启动新一轮的基因组学战略规划★ღ，描绘2020年愿景★ღ，以促进科学转化与医学突破★ღ。目前这一规划正在广泛征集意见与建议★ღ。新愿景将在2020年10月发表★ღ，以庆祝“人类基因组计划”（HGP）启动30周年★ღ。
“人类基因组计划”于20世纪80年代★ღ，在一片争议中开始孕育★ღ，并于1990年正式在美国启动★ღ。随后★ღ，该计划逐步国际化★ღ，成为国际合作项目★ღ，并于2003年正式宣告完成★ღ。“人类基因组计划”是人类历史上对生命最大规模的探索★ღ，也是人类自然科学史上参与国家最多★ღ、协调最成功的超大型国际合作研究计划★ღ，与登月计划和原子弹爆炸并称二十世纪三大科学工程★ღ。
NHGRI在此时酝酿基因组学2020年愿景★ღ，不仅由于学科发展正好到了一个关键时点★ღ，也有着某些特殊意义★ღ。2018年★ღ，是纪念基因组学科学里程碑的一年★ღ：是“人类基因组计划”正式宣告完成的第15个年头★ღ，亦是1953年发现DNA双螺旋结构的65周年★ღ。NHGRI为此总结了基因组影响世界的15个方面★ღ。我们老百姓关注的基因检测也在其中祭亡灵杀手★ღ。无论我们是否意识到★ღ，基因组有关的知识★ღ、技术与理念★ღ，已经开始走进我们日常生活的很多方面★ღ。
面向精准医学的大人群基因组计划已经陆续启动★ღ，其中既有国家层面的动作★ღ、亦不乏机构与企业的行动★ღ，相信大家都有所耳闻★ღ。
已经启动大人群基因组医学计划的国家★ღ，既有曾经参加过“人类基因组计划”的老牌基因强国（如美凯发网站★ღ，★ღ、英★ღ、法★ღ，中等）★ღ，也有一些新的成员（如澳大利亚★ღ、爱沙尼亚★ღ、沙特★ღ、阿联酋和土耳其等国家★ღ，也启动了10万人或以上规模的项目）★ღ。我从自己的关注点对这些项目做了一些梳理★ღ。在整理过程中★ღ，有两个问题萦绕心间★ღ：为什么这些项目在短时间内陆续启动？主要依据或条件又是什么？这里也附上自己的一些思考★ღ，期待与大家交流★ღ。
英国政府于2012年启动了“10万人基因组计划”（100,000 Genomes Project）★ღ。该计划聚焦罕见病★ღ、部分肿瘤及感染性疾病★ღ，通过对NHS患者进行基因组测序★ღ，将基因组数据与健康数据进行连接★ღ，一方面直接服务于临床★ღ，另一方面★ღ，这些数据也共享给科研人员★ღ，从而促进病因探索并服务于疾病治疗★ღ。
英国专门成立了一家名为Genome England的公司k8凯发天生赢家一触即发★ღ，负责该计划的运行★ღ。测序工作由NHS认定的基因组中心承担★ღ，目前已有分布全国的13家基因组中心参与进来★ღ。此外★ღ，还有十余家企业也参与了这一计划★ღ，他们的职责是推动药物开发以及诊断方法的研发与转化★ღ。
英国在2006年还启动了另外一项长期科研计划—UK BioBank★ღ。这个项目要通过对50万志愿者的长期跟踪★ღ，来研究遗传易感性与环境暴露对疾病的影响★ღ。
今年10月初★ღ，英国健康与社会医学部宣布将在未来五年完成500万基因组测序★ღ。同时★ღ，从2019年起★ღ，NHS会将全基因组测序（WGS）作为一项常规检测★ღ，用于重病患儿★ღ、特定罕见病及难治性疾病的成年患者的诊疗★ღ。新闻中还提到★ღ，NHS的基因组医学服务将扩展已有的项目★ღ，包括上述10万人基因组计划★ღ，NHS与UK BioBank 将会未来五年完成100万的全基因组测序★ღ。
作为是HGP的发起国★ღ，美国在这方面早有规划★ღ，经过酝酿准备★ღ，先后在2016年发起“精准医学倡议”（PMI★ღ，Precision Medicine Initiative）★ღ，在2017年启动“我们所有人” 计划（AOU★ღ，All of Us）★ღ，后者是前者的重要组成部分★ღ。
AOU将建立超过100万人的大型队列★ღ。这是一项需要志愿者参与★ღ、以数据为驱动的计划（并不是以某个假说为驱动）★ღ，最终目标是加速疾病机制研究★ღ，将精准医学应用于所有疾病提高健康★ღ。“我们所有人”并不聚焦某种特定疾病★ღ，而是要打造国家级的研究资源★ღ，为相关科研提供支撑★ღ、以探索更为宽广的疾病健康问题★ღ。
美国还有另一个大人群计划★ღ，即“百万退伍军人项目”（MVP）★ღ。该计划由美国退伍军人事务部（VA）于2011年启动★ღ，将采集100万退伍军人的医学与基因组信息★ღ，发现健康与疾病相关基因★ღ，服务于退伍军人的医学保健★ღ。2016年凯发官方网站★ღ，★ღ，该计划与PMI合作★ღ，将现役人员也纳入进来★ღ。目前★ღ，该计划已经完成50万人的入组★ღ，并开始寻求扩展全基因组测序的能力★ღ。同时★ღ，VA也已启动与美国能源部在超算方面的合作★ღ。
2016年祭亡灵杀手★ღ，法国宣布启动“法国基因组医学2025”（Genomic Medicine France 2025）★ღ，预通过十年时间★ღ，将法国打造成基因组医学的引领者★ღ。该计划拟建立覆盖全国的基因组医学网络★ღ，包括12家基因组测序平台★ღ，并计划鼓励国家机构与产业部门合作★ღ；到2020年★ღ，每年完成23.5万的基因组测序★ღ，涉及肿瘤与罕见病★ღ，随后将扩展到常见疾病★ღ；到2025年★ღ，建立全国性框架★ღ，促进相关领域的科技创新与经济增长★ღ。
2017年12月28日★ღ，新闻联播报导了我国将启动“中国十万人基因组计划”★ღ。报导称这是我国在人类基因组研究领域实施的首个重大国家计划★ღ，也是世界最大规模的人类基因组计划★ღ，目标是绘制中国人精细基因组图谱★ღ，项目为期四年k8凯发天生赢家一触即发★ღ。放眼国际★ღ，这一计划就其规模并非全球最大★ღ。目前尚未看到更加具体的项目信息★ღ。
十三五以来★ღ，我国一些地区★ღ、行业学术团体★ღ、高校★ღ、机构与企业也都启动了不同规模的精准医学大人群基因组计划★ღ。如★ღ，解放军总医院联合联合有关学会启动的“中国聋病基因组计划”★ღ、复旦大学附属儿科医院联合有关学会发起的“新生儿疾病基因组计划”★ღ，都是面向临床的大型基因组计划★ღ。复旦大学联合有关单位发起的泰州人群健康队列★ღ、江苏省沿江地区自然人群队列研究★ღ，目标也是服务于精准医学研究★ღ。
作为中国1%计划的主要贡献者★ღ，华大基因也有其思考与规划★ღ。大群体基因组分析一直是研究生物学性状/疾病遗传基础的重要策略★ღ。为加速科研★ღ、推动应用转化★ღ，华大曾在2011年提出了“3M”的构想★ღ，即启动3个100万基因组计划★ღ，包括100万动植物★ღ、100万微生物★ღ，以及100万人类个体祭亡灵杀手★ღ。经过酝酿★ღ，在2016年正式发起“百万人群基因大数据研究”项目★ღ，并在前不久发表了第一期的研究成果（参见下图）★ღ。
这项工作通过对14万余例孕妇的NIPT数据汇总进行群体水平的分析★ღ，从而有了不少新的科学发现★ღ。这项研究从医学检测服务产出的大数据入手★ღ，通过对基因大数据的分析与研究★ღ，可以更深刻的认知健康与疾病★ღ，进一步促进疾病预防诊断与防控★ღ。华大这几年提了从民生大人群数据切入★ღ、带动产★ღ、学★ღ、研联动的可持续发展的模式★ღ，这篇论文就是一个例证★ღ。
澳大利亚在2018年发起了“澳大利亚基因组健康未来使命”（Australian Genomics Health Futures Mission）★ღ。这一投入为5亿澳元（约3.7亿美元）的基因组计划★ღ，将启动扩展性的旗舰式临床研究★ღ，应对罕见病★ღ、罕见癌症和复杂疾病★ღ、鼓励最新成果与技术用于临床★ღ，促进产学研合作祭亡灵杀手★ღ、制定国家标准和方案★ღ，加强数据使用★ღ、分析与共享★ღ，提升基因组学的医学实践价值★ღ。该计划的首个项目名为“Mackenzie的使命”★ღ，这是一项罕见遗传性疾病的孕前筛查临床试验★ღ，耗资2000万澳元（项目以因罕见病去世的患者Mackenzie Casella来命名）★ღ。
“爱沙尼亚基因组计划”（Estonian Genome Project）于2000年启动★ღ，目标是提升国家公共健康水平k8凯发天生赢家一触即发★ღ。2017年底★ღ，该计划宣布将斥资500万欧元（约590万美元）用于2018年对10万人进行基因分型★ღ。坐落于塔尔图爱沙尼亚基因组中心的爱沙尼亚生物库 ★ღ，目前已经采集到来自“爱沙尼亚基因组计划”一期的标本共5.2万例★ღ。在新一阶段中★ღ，计划会将遗传风险通过国家健康信息系统反馈给参与人祭亡灵杀手★ღ。
“沙特人类基因组计划”（Saudi Human Genome Program）于2013年启动★ღ，计划五年内完成10万例健康与疾病标本的测序★ღ。尽管沙特并非人口大国★ღ，却面临一些特殊的健康问题★ღ，如新生儿重度遗传病患病率高★ღ，糖尿病与肥胖症等常见病的患病率也较高★ღ、近亲婚配比例高等★ღ，这些都是导致沙特巨额健康支出的原因★ღ。有报道显示★ღ，2016年年底★ღ，该计划已经开发了13个基因panel★ღ， 涵盖5000余种遗传疾病★ღ，完成了超过1万例遗传病患者标本的测序★ღ，发现了数百个沙特人群相关的遗传变异★ღ。
“迪拜基因组”计划（Dubai Genomics）于2018年启动★ღ。该计划拟对300万迪拜居民进行全民基因组测序★ღ。计划第一期为期三年★ღ，将主要建立基础设施并大规模全基因组测序★ღ；第二期侧重部署人工智能建设★ღ，以用于复杂信息分析★ღ，准确预测遗传相关的疾病风险★ღ；第三期将联合制造业★ღ、学术机构共同开发精准治疗★ღ。“总比世界其他城市领先10年”是迪拜的城市口号★ღ。“迪拜基因组”只是迪拜为全面打造世界领先城市所制定的宏伟计划“Dubai 10x”之一★ღ，可谓信心满满且荷包充盈★ღ！
横跨欧亚大陆的土耳其于2018年启动了“土耳其基因组计划”（Turkish Genome Project）★ღ。该计划第一期将利用三年时间★ღ，完成10万居民的基因测序★ღ；第二期拟在2023年（建国100周年）扩展到100万人★ღ。计划目标是绘制遗传结构★ღ、发现肿瘤等慢性病以及特定长寿群体的遗传基础★ღ。
很多媒体将英国列为世界上第一个对大规模人群进行DNA测序的国家★ღ。这不禁让我想到了冰岛★ღ。这里想特别提一下它★ღ，并非由于近期有什么大动作★ღ，而是因为这个北欧小国曾拥有著名的生物公司deCODE genetics（简称deCODE）★ღ。这是一个在遗传基因组届无法忽略的名字★ღ。
deCODE 成立于1996年★ღ，目标是研究常见病与基因的关系★ღ，用于指导药物开发★ღ。也许是维京血统的原因★ღ，deCODE在90年代末曾大胆提议冰岛政府创建全球首个全人群的基因组生物库（冰岛当时的人口数是27万）★ღ。1998年★ღ，冰岛国会通过了健康数据库法案★ღ，允许企业参与建设★ღ、使用这一数据库★ღ。deCODE很快就拿到了相关授权★ღ。
有了大人群研究材料★ღ，deCODE在心脑血管疾病★ღ、肿瘤以及精神分裂症等复杂疾病的基因研究中★ღ，取得了不俗的成绩★ღ。同时★ღ，他们也是全球首批推出直接面向消费者的基因检测服务的公司之一★ღ，于2007年推出了 deCODEme★ღ，售价$985★ღ，通过口腔拭子标本为消费者提供疾病风险和祖源信息★ღ。这项业务已于2013年终止★ღ。
先行者往往孤独★ღ，deCODE因其超越时代的强势做法备受争议★ღ，甚至成为一些文学作品的抨击对象★ღ。《如瓮之城》（Jar City）就是这样一部作品★ღ，这本小说后来被拍成了电影★ღ，曾经横扫当年冰岛电影市场★ღ。
不过★ღ，学术界对这家公司还是比较认可的★ღ。美国人类遗传学学会（ASHG）将2017年的威廉艾伦特别贡献奖颁发给了公司创始人卡尔· 斯特芬森（Kári Stefánsson）★ღ，以奖励其在人类遗传学领域作出的重大而深远的贡献★ღ。我当时也在大会现场★ღ，想到deCODE从纳斯达克退市★ღ、破产到被收购的命运★ღ，老先生的获奖发言令人感怀不已★ღ。
这么多大人群的基因组计划在短时间内涌现出来★ღ，让人有一种“忽如一夜春风来★ღ，千树万树梨花开”的感觉★ღ。但如果我们回顾历程凯发在线网址★ღ，★ღ，结合科技发展与时代进步★ღ，你会发现这些面向精准医学的大项目早已在规划中★ღ，目前的局面只是水到渠成的事★ღ。
2003年★ღ，在“人类基因组计划”正式完成之际★ღ，计划主要协调人★ღ，时任美国国家人类基因组研究所的柯林斯（Francis Collins）, 就提出了“基因组结构到基因组生物学★ღ，再到疾病生物学和医学科学”的路线图★ღ。这意味着HGP并非是一个单纯的科研工程项目★ღ，其最终目标是要将成果转移到经济和社会效益上★ღ。
美国是“人类基因组计划”的发起国★ღ，美国国家人类基因组研究所（NHRGI）提出的基因组学科发展规划★ღ，不仅是本国学科发展的纲领★ღ，亦对国际有重要借鉴意义★ღ，在某种程度上反映了全球基因组学科发展的的趋势★ღ。作为国家基因组学专业机构★ღ，NHGRI的战略部署具有较好的前瞻性★ღ、系统性与开放性★ღ，可谓环环相扣★ღ、每一步都踩在点上祭亡灵杀手★ღ。这一点k8凯发天生赢家一触即发★ღ，值得我们好好学习★ღ。
2011年★ღ，美国的国家爱科学委员会发表了《迈向精准医学★ღ：建立生物医学知识网络与疾病新分类体系》★ღ，建议启动“百万美国人基因组计划”（Million American Genomes Initiative★ღ，MAGI)与“糖尿病代谢组计划”★ღ。英国在次年了启动的“十万人基因组计划”★ღ。
2015年1月★ღ，时任总统奥巴马在白宫宣布了精准医学倡议的具体内容★ღ，并启动一系列计划★ღ，其中包括“百万人基因组计划”（资助NIH 1.38亿美元）★ღ。该计划首先要征集100万的志愿者并做好队列及对照★ღ。建立与临床有关的“史无前例的大数据”★ღ，收集基因组数据与临床信息★ღ。这之后★ღ，就有了“精准医学倡议”与“我们所有人”计划★ღ。
我们每个人都是独一无二的★ღ，健康与疾病★ღ，与自身基因组★ღ、生活环境★ღ、生活方式息息相关★ღ，并具有复杂性★ღ。大人群大数据★ღ，有助于揭示其中蕴含的知识与规律祭亡灵杀手★ღ，更加接近健康与疾病的本质★ღ，帮助我我们找到可以防治疾病★ღ、提高健康的方法★ღ。
研究工具★ღ，特别是基因测序与信息学工具的创新与完善★ღ，使得规模化研究成为可能★ღ。大数据时代的呼唤★ღ，相关技术与工具的发展也是重要因素★ღ。
对于测序工具★ღ，我们上次展望了测序技术发展小型化的趋势★ღ。其实★ღ，还有另外一个重要趋势★ღ，即超高通量的测序技术★ღ。目前★ღ，很多大人群基因组计划都遇到了测序通量不够的瓶颈★ღ，限制了项目进度★ღ。大型基因组计划需要重器★ღ，方能满足其所需要的测序能力★ღ。
千人基因组计划★ღ、癌症基因组计划这类大规模研究★ღ，其初步成果已经显现★ღ。相比经典的以假说为驱动的研究★ღ，这类以数据为驱动的研究往往能够显著提高科学发现的效率★ღ。以前的大项目也给了我们大型计划的规划★ღ、组织协调与实施经验祭亡灵杀手★ღ。
基因组技术已经走入临床实践★ღ，以基因组序列为主要研究基础的精准医学理念也日渐接受★ღ。你能发现★ღ，上面很多大人群基因组计划★ღ，都是科研与临床同步开展★ღ。这是因为★ღ，基因测序仪及其他工具如质谱技术★ღ、医学影像★ღ，可以同步服务于科研与临床★ღ。新技术从实验室走向医学服务★ღ，又从服务反馈科研★ღ，这是一个良性循环★ღ，也是新技术价值所在★ღ。
以上★ღ，是我作为一名基因组科技工作者的粗浅理解★ღ，难免思虑不周★ღ。近期★ღ，汪建老师在华大内部培训中★ღ，提到了基因科技发展到现阶段具备科学性★ღ、技术性★ღ、经济性★ღ、政治性★ღ、时代性与实践性★ღ，我觉得正是对上述问题高屋建瓴的精辟回答k8凯发天生赢家一触即发★ღ。
【声明】生命科学与基因技术正在高速发展★ღ，针对同一研究课题★ღ，不同团队的研究结果存在差异甚至相悖的可能★ღ。另受本人知识结构及参阅资料准确性的局限★ღ，文章内容仅供参考★ღ。欢迎读者随时纠错并参与讨论★ღ。
